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2020也不差-单细胞天地编辑团队全体成员有话说

生信技能树 单细胞天地 2022-08-10

在周运来的提议下,我们开启了一个颇有仪式感的元旦寄语活动,所以大家在2021年的1月1号的0点看到了这封由单细胞天地编辑团队全体成员“拼凑”出来的信。

蓦然回首,发现在这个已经是去了的几乎每天都是在“见证历史”的2020,咱们其实也不差,该发文章的发文章,该找工作的找到了心仪的工作。咱们《单细胞天地》公众号的每日更新也没有停,仅仅是这个坚持就足以让我们在技术型自媒体名列头部啦,所以我才会被邀请去腾讯大厦,见:感谢粉丝的5星大力支持,我被腾讯的云+社区邀请参加他们的年终盛典。而且地球也还在转,香港机场也没有被炸毁,疫苗也要全民免费啦,2021,想想都会很美好!

既然是周运来提议的, 那我们就以他的寄语作为开头吧:

分享一首《清平乐·会昌》 东方欲晓,莫道君行早。踏遍青山人未老,风景这边独好。会昌城外高峰,颠连直接东溟。战士指看南粤,更加郁郁葱葱。


  • 用勇气改变可以改变的:
  • 用胸怀接纳不能改变的:
  • 用智慧来区别两者的不同。

然后是我们《单细胞天地》公众号的总编辑的寄语:

回顾起来2020年的开局感觉有一点不真实的荒诞。意外说来就来,前几个月一直居家隔离,除了每天编辑公众号,别的事情好像都懈怠了,期间规划的学习计划也都没有执行下去。但也并非全无收获,这段时间也是最近几年在家跟父母待时间最久的一次。后面在正常的实验学习之余陆陆续续翻译了一个专辑“HBC合辑”以及重新设计更新了公众号logo,见:号外!号外!单细胞天地更新了。公众号能够一年持续更新,全靠各位小编的顶力输出,在此真的要感谢一直坚持更新几乎没有稿费的全体小编们(特别是周运来老师)。也要感谢各位读者的关注。2020注定是不平凡的一年,整个一年几乎都笼罩在疫情的影响之下。但我们也要对生活抱有期待,永远相信美好的事情即将发生,冬天的尽头即是春暖花开。再见2020,你好2021。

接下来我们的团队成员一一出场

米妮

感谢您让我认识你,在您的带领和影响下,我觉得我还是不够努力和优秀。回想自己加入单细胞天地的编辑也快一年,但是和群里高产的大佬们比,自己写的文献阅读的推文也不过几篇,而且我每次都有看自己文献阅读推文后的读者留言,都很少,总结下自己2020年的创作就是:深度和专业性都不够,文献阅读也是机械性的翻译文献,并没有在我读懂的基础上用更专业和易理解的中文来面对读者解读文献。

2021即将到来,我已经下定决定要走向精准医学(生信方向)的博士路程,所以希望自己可以在这一专业领域有所作为,所以我还要不断的提高自己文献阅读以及交流的能力,明年还要继续写单细胞天地文献推荐系列的推文,并且多读多看其它编辑的推文来提升自己,同时也多和群里的编辑们多交流。本科背景属于计算机类,对于生信软件,算法,分析流程的使用和学习易于上手,所以来年自己也要多写写这类技术描述指导类的推文,让自己能够学习这些数据分析的步骤和教程,同时也能和大家一起分享交流共进,这些就是我在单细胞天地奋斗的目标了。感谢健明前辈提供这样的一个平台,相当于监督自己学习和进步了,哈哈哈!

元旦寄语:2020,遇见单细胞天地是过去,但不会是结束,在单细胞天地看的每一篇推文要么是你脑子里发光的细胞,要么就是你大脑风暴的源泉,如果都不是,那就是你手机提醒你的内存不足了,哈哈!来年大家一起努力,你不光可以是个读者,你还可以做个推文原创作者的话痨!

记得两年前刚刚接触单细胞的时候,自己是小白一枚,搜素各种资料,恶补相关知识。最后,发现单细胞天地公众号,非常适合入门。现在自己有幸加入了单细胞天地团队,紧跟单细胞天地学习了单细胞的新进展和技术。加入单细胞天地两年来,自己提供的推文主要是单细胞文献解读与单细胞测序基础知识。今年下半年以来,由于自身和工作的原因,提供的稿件比较少,有愧于我们的编辑团队。同时,自己的简书和语雀更新的也比较少。新的一年希望除了解读单细胞最新文献,也希望能在单细胞分析上提供推文,更进一步。在学生信这件事上我们还是坚持长期主义,与大家共勉。

生信会客厅

2020年我在闲暇时写了单细胞转录组分析的两个专题,本意是希望藉此结交几个志同道合的生信圈朋友,大家遇到问题时可以交流探讨共同提高。没想到这几篇文章得到了健明老师的肯定,并通过单细胞天地的平台分享出去,让我有机会添加了几百位研究单细胞的微信好友。随着生信朋友圈的扩大与交流机会的增加,我每天都有会收到来自分析实践的问题,这些提问开阔了我的眼界、促进了我的思考,也提升了我的能力。在此,感谢健明老师和永杰兄,以及与我交流探讨的朋友,你们让我的2020收获满满!

展望2021,我希望不辜负大家的信任与支持,做好以下几件事情:在生信分析环境搭建方面继续努力;努力写好一个空间转录组分析的专题;在单细胞多组学分析方面做更多探索。

Yiran

接触单细胞在2018年,后面发现单细胞天地,跟着教程以及视频一点点开始学习,前面10X的经典PBMC数据学习的时候,感觉两个字-惬意,到开始自己做单细胞实验,换成另外两个字,焦虑,后面陆陆续续写了一些文献分享以及软件教程~

“惬意”的原因在于,单细胞天地里有特别全面的教程和文献,学习的过程上手特别容易,而且文献中相关figure也很容易复现,觉得自己每天都在进步!PS:单细胞分析更加看重的是R语言的基础,如果觉得你分析单细胞有难度,那么请考虑参加生信技能树的入门课程吧(生信爆款入门-第12期(今年最后一期)),前一段给师弟报了这个课程,几周的时间,基本已经可以按照提供的代码自己来做很多分析了!

“焦虑”的原因有很多,归根结底还在于,越多越多疾病的单细胞文章发表,临床样本又存在着不确定性,所以就特别担心自己研究的领域单细胞结果被抢发,有时候做梦都在想着怎么做实验和分析,和以前做其他方面实验完全不同的感觉。目前手里也有接近20多例单细胞数据,2021年打算把文章分析过程,一步一步记录下来,一方面投稿的时候需要提供代码,另外文章发表后,把整个过程分享给大家,包括cytof以及流式数据和单细胞数据互相比较这些~

到年末了~jimmy大佬希望大家给读者写一些新年寄语,首先肯定祝福单细胞天地越办越好,jimmy大佬公司早日上市,其次祝福正在做单细胞或者希望做单细胞的都早日发paper,最后,祝福单细胞天地的朋友们新年快乐,身体健康~

PS:我们是目标是细胞大海!

ahworld

2020年,以撰写《单细胞轨迹分析知多少--拟时间分析比较》开始,陆续撰写了27篇微信文章,很荣幸其中有10多篇被单细胞天地转载,最高阅读量的就是这篇关于拟时间解读的文章了,目前达到2070人阅读。整体产量比较小,除了本身日常工作比较多,写分享是副业之外,很重要原因是大多内容都被写很多人遍了,所以求新,就像《dyno | 使用教程--1个R包实现59种单细胞轨迹推断分析》,力求能分享一些自己没有看到过的教程,让自己有一些挑战和提高;再一个就是想做一些完整脚本或函数的分享,就像《R函数实现单细胞StackedVlnPlot》和《单细胞数据质控-双细胞预测-doubletdetection VS scrublet》,希望读者能够直接使用,减少更多的摸索时间。

2021年给自己定一个目标是达到50篇,希望围绕三维基因组和单细胞之外涉猎更多的领域和内容分享,除了生信分析之外的内容之外,有一些关于酷酷的个人博客搭建更新策略、docker、k8s以及流程搭建方面的经验希望写出来分享。

火烧甜蛋茶

前半年自己还在追随单细胞热点,基本上一到两个月写出来一篇单细胞文献速递稿件,在2020年一共写了5篇稿件。到了后半年自己学习单细胞分析的过程中发现转录组基础不大好,就跑去学习了转录组分析流程的知识了,还参加生信技能树官方举办的学习班 :

虽然不是时刻紧跟了,但是也知道单细胞技术发展的如火如荼,在一篇关于单细胞技术发展的文章里看到这样的描述:“人类基因组和新一代测序技术之后的另一个革命是单细胞技术”。不管是单细胞基因组、转录组还是空间转录组技术等等,在今年对抗新冠肺炎的疫情中也被充分利用,发挥了重要作用,文章层出不穷。

在2021年,我计划补充完善自己的转录组知识,能掌握单细胞转录组分析知识,并且学会总结知识,继续分享文献或者是学习心得给关注单细胞技术的小伙伴们~

Ting

感谢能加入单细胞天地,认识做单细胞的大拿,跟小伙伴一起研读文献,督促自己学习进步。过去的一年自己刚涉足单细胞,没做太多贡献,希望新的一年能认真坚持,向笔耕不辍的劳模们学习,分享更多干货,形成阅读和写作的习惯。遗憾没能参加线下举行的活动,但很喜欢设计的新图标,T恤和新年活动,希望以后能跟大家有更多的交流。

祝单细胞天地和生信技能树越办越好,粉丝越来越多!

元旦快乐,吉祥如意!

Hu Zhang

哈哈哈,大家新年快乐哈,作为一名单细胞文献阅读爱好者,明年的目标在单细胞天地发表10篇,我也会继续做好科普工作。毕竟,像我这样把读文献当业余爱好的也不多哈!大家新年快乐,心想事成!

doctor yang

这一年没怎么投稿,疫情期间因为开题,看了很多文献,就投了篇关于文献分享的内容。而后,为了毕业,自己学了很多关于TCGA挖掘的内容,收获很多,只是因为时间紧张,一直没空写而已。期间抽空写了篇关于批次校正的推文。

经过3个月的折腾,终于写完了文章。待文章接收,我考虑将整个分析流程写成一个系列。供大家一起学习毕业。

老牛

作为一个低产者,本人今年只写了两、三篇单细胞相关的推文,但也有幸加入了单细胞天地编辑的群体,见识了一众的大佬,收益良多。回首2020,或者说最近十年,我一直陷入了两件事的思考,一是我是谁?二是我该往哪里去?如今第二件事暂时有了着落,明年开始读博,找一个临时的避风港去思考第一件事哈哈哈。所以我想2021,会有更多的时间去做去写作、去分享,和大家一起去细品这个时代的变化。最后,新的一年,我希望,每一个读者也都变成一个分享者,只有分享才能更好的成长!

登峰

2020年我由单细胞分析彻底转向了三维基因组分析,从此开始了漫长且痛苦的分析与校稿过程。三维基因组与表型的关联并未像转录组学一般紧密,因此在研究过程中的充实感远不如做转录组学的一系列东西来的更快。2020年我写了几篇scHIC的稿子,自我感觉比较乏味,没有scRNA-seq的欣快感蕴含其中。

于生信学习上我是比较失败的,无法掌控自己的学习轨迹,每天忙于完成导师的各项任务,疲于应对老板的苛责。仔细想来,我似乎抛却了当时入门的理想:回答:胚胎细胞是什么?这个问题。

总之,希望自己,还有单细胞天地的各位读者,不忘初心,记得自己是从何处出发,又要去往何处的——要探寻风暴,就向风暴深处进发。不要迷失在无关紧要的气旋中去。

刘小泽

自2019年加入单细胞天地,再到2020年,看着队伍一点点壮大,关注单细胞的人越来越多,感觉到真的是日新月异的学习过程,不同工具、算法不停迭代升级,越来越方便科研用户的分析需求。大量的教程喷涌而出,降低了更多想做单细胞的科研者的准入门槛。新的一年,希望各位读者持续关注单细胞天地,共同进步!

信你个鬼的2021年新年展望

有幸在健明老大的带领下进入了单细胞的天地,粗浅的写过几篇稿子,然后拿到单细胞天地编辑群的入门券。

新的一年,会关注单细胞的表观方向以及多组学联合分析。祝大家新年快乐,不要长肉。

武汉光谷-赵芬菲

2020年,仅在公众号发表两篇推文,在稀里糊涂中度过,直到这个特别的平安夜,被通知公司架构调整,深切感受到渺小如蝼蚁、如草芥,2021年,想学习新技能,持续走上坡路,与君共勉。

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